من المقرر بدء تنسيق المرحلة الثالثة بعد انتهاء نتيجة تنسيق تحويلات تقليل الاغتراب، عبر موقع التنسيق الإلكتروني، ويشمل تنسيق المرحلة الثالثة 2025 شريحتين أساسيتين، وهما الأولى الطلاب الناجحون في الدور الأول ممن لم يتم ترشيحهم خلال المرحلتين السابقتين، والثانية الطلاب الذين اجتازوا امتحانات الدور الثاني فور إعلان نتائجهم.